ENCYCLOPEDIA · TESTS-001 · Обновлено 29.06.2026
Анализы микробиоты
Иванова Мария Сергеевна, MD, PhD
Гастроэнтеролог · Стаж 12 лет · Рецензент: Петров А.И., MD
Анализы микробиоты кишечника включают посев кала на дисбактериоз, ПЦР и анализ токсинов C. difficile, 16S rRNA секвенирование, метагеномный анализ и копрограмму. Эти методы позволяют оценить состав и функцию микробиоты, выявить патогены и определить показания к трансплантации фекальной микробиоты (ТФМ). Правильная подготовка к анализам критична для достоверности результата.
STOOL-CULTURE-DYSBIOSIS
Посев кала на дисбактериоз
Качественный и количественный состав аэробной и факультативно-анаэробной флоры кишечника. Выявляет снижение бифидо- и лактобактерий, избыточный рост условно-патогенной флоры.
ПОКАЗАНИЯ
- ·Подозрение на дисбиоз после антибиотиков
- ·Хроническая диарея
- ·Контроль после ТФМ
- ·Частые инфекции
ПОДГОТОВКА
За 3–5 дней отменить пробиотики, ферменты, слабительные. Кал собирать в стерильный контейнер без примеси мочи. Доставить в лабораторию в течение 2 часов.
ИНТЕРПРЕТАЦИЯ
Снижение бифидобактерий <10⁹ КОЕ/г, лактобактерий <10⁷ КОЕ/г, повышение кишечной палочки >10⁸ или появление гемолитических штаммов указывает на дисбиоз.
РЕФЕРЕНСНЫЕ ЗНАЧЕНИЯ
Бифидобактерии: 10⁹–10¹⁰ КОЕ/г · Лактобактерии: 10⁷–10⁸ КОЕ/г · E. coli: 10⁷–10⁸ КОЕ/г
PCR-CDIFF
ПЦР C. difficile
ДНК Clostridioides difficile в кале методом полимеразной цепной реакции. Высокочувствительный метод выявления возбудителя.
ПОКАЗАНИЯ
- ·Диарея после антибиотиков
- ·Подозрение на псевдомембранозный колит
- ·Контроль излеченности
ПОДГОТОВКА
Кал собрать в стерильный контейнер. Транспортировка при +2…+8°C в течение 24 часов. Не замораживать.
ИНТЕРПРЕТАЦИЯ
Положительный результат подтверждает наличие C. difficile. Для оценки токсигенности требуется дополнительный анализ на токсины A/B.
РЕФЕРЕНСНЫЕ ЗНАЧЕНИЯ
Отрицательно (ДНК не обнаружена)
16S-RRNA
16S rRNA секвенирование
Состав и относительное abundance бактериальных таксонов кишечника на основе секвенирования гена 16S рибосомальной РНК. Определяет разнообразие микробиоты (альфа- и бета-разнообразие).
ПОКАЗАНИЯ
- ·Оценка состояния микробиоты
- ·Научные исследования
- ·Контроль эффективности ТФМ
- ·Хронические заболевания ЖКТ
ПОДГОТОВКА
Кал собрать в специальный набор с консервантом. Избегать контаминации. Хранение при комнатной температуре до 30 дней.
ИНТЕРПРЕТАЦИЯ
Индекс Shannon <3, снижение Bacteroidetes/Firmicutes, дефицит SCFA-продуцентов (Faecalibacterium, Roseburia) указывают на дисбиоз.
РЕФЕРЕНСНЫЕ ЗНАЧЕНИЯ
Shannon ≥ 3.0 · Содержание Bacteroidetes + Firmicutes > 80% · SCFA-продуценты > 5%
METAGENOMIC
Метагеномный анализ
Полный геномный анализ всех микроорганизмов кишечника (бактерии, археи, вирусы, грибы). Определяет функциональный потенциал микробиоты и пути метаболизма.
ПОКАЗАНИЯ
- ·Глубокая оценка микробиоты
- ·Научные исследования
- ·Персонализированный подбор терапии
- ·Сложные случаи дисбиоза
ПОДГОТОВКА
Кал в наборе с консервантом. Избегать приёма антибиотиков 4 недели до анализа. Хранение при комнатной температуре.
ИНТЕРПРЕТАЦИЯ
Оценивается функциональный профиль (KEGG-пути), разнообразие, соотношение продуцентов/потребителей SCFA, наличие патобионтов.
РЕФЕРЕНСНЫЕ ЗНАЧЕНИЯ
Индивидуальная интерпретация по референсным базам (HMP, GMrepo)
COPROGRAM
Копрограмма
Общий анализ кала: макроскопические, микроскопические и химические показатели. Оценивает переваривающую способность, наличие воспаления, крови, паразитов.
ПОКАЗАНИЯ
- ·Хроническая диарея/запор
- ·Боли в животе
- ·Подозрение на мальабсорбцию
- ·Контроль заболеваний ЖКТ
ПОДГОТОВКА
За 3 дня исключить препараты железа, висмута, активированный уголь. Обычная диета. Кал без примеси мочи и менструальной крови.
ИНТЕРПРЕТАЦИЯ
Наличие непереваренной клетчатки, мышечных волокон, нейтрального жира, крахмала указывает на нарушение пищеварения. Лейкоциты и слизь, признаки воспаления.
РЕФЕРЕНСНЫЕ ЗНАЧЕНИЯ
Оформленный кал · без крови и слизи · непереваренных волокон нет · pH 6.8–7.6
TOXINS-AB
Анализ на токсины A/B C. difficile
Обнаружение токсинов A и B Clostridioides difficile в кале иммуноферментным методом (ИФА). Подтверждает токсигенность штамма и клиническую значимость.
ПОКАЗАНИЯ
- ·Положительная ПЦР на C. difficile
- ·Клиническая картина псевдомембранозного колита
- ·Решение о назначении ТФМ
ПОДГОТОВКА
Кал собрать до начала этиотропной терапии. В стерильный контейнер. Доставка в течение 2–4 часов при +2…+8°C.
ИНТЕРПРЕТАЦИЯ
Положительный результат в сочетании с клиникой подтверждает активную инфекцию. Отрицательный при положительной ПЦР, колонизация без токсинообразования.
РЕФЕРЕНСНЫЕ ЗНАЧЕНИЯ
Отрицательно (токсины не обнаружены)
СВЯЗАННЫЕ РАЗДЕЛЫ
Информация носит исключительно информационный и образовательный характер. Не является медицинской рекомендацией, диагнозом или назначением. Референсные значения могут отличаться в зависимости от лаборатории. Интерпретацию результатов должен проводить лечащий врач.